荞麦机厂的卫生如果不多加注意，就会滋生害虫，对整个生产造成严重影响，所以要对其进行防治工作。

缩短储存周期。荞麦粉集中生产，及时发放，荞麦粉储存周期越短，滋生虫子的几率就越小。

卫生防虫。夏季生产车间不留死角，不给荞麦粉中虫卵繁殖的空间。停机后，把设备和管道内多余的物料清空，虽然会造成一些清机粉，但主要销毁了虫子滋生的根源，从很大程度上控制了虫害。车间和库房要通风良好，因为荞麦粉有呼吸作用，所以使空气流通，储存荞麦粉的周围环境，不能有异味，离墙离地以减低荞麦粉受污染的几率，减少虫鼠滋生。

药物熏蒸和惰性气体杀虫。药物熏蒸和惰性气体杀虫。夏季集中停机，对生产设备进行专业的化学熏蒸剂进行熏蒸。此方法优点是杀死绝大部分虫卵，缺点是熏蒸周期太长，影响市场销售。